講師：大沼　亮（おおぬま　りょう）

学位：博士（理学）

担当授業科目

（学部）海洋生物学、、共生細胞生物学、生物学演習、臨海実習I, II
（大学院）生物多様性概論II、系統分類学特論、論文購究I, II、特定研究I, II、生物多様性特論II
（全学共通教育） 生物学各論C2、瀬戸内海学入門

研究の興味

　藻類・植物の葉緑体は、もともと葉緑体を持っていない生物が光合成をして生きる生物を細胞内に取り込み、やがては1つの生物として統合するという「細胞内共生」という現象に由来するオルガネラです。この細胞内共生による葉緑体の獲得は、真核生物のあらゆる系統で生じており、葉緑体をもたない生物を「藻類化」する進化の強力な原動力です。 2つの生物が1つの生物になったことで誕生した藻類ですが、その細胞内共生の進化プロセスにはたくさんの謎が残されています。本研究室では、まさに今、藻類化する途中であるかのような「盗葉緑体現象（＝他の生物の葉緑体を盗んで一時的な共生を成立させる現象）」を示す生物を対象として、藻類ではない生物を藻類化した強力な進化に隠された謎を解き明かすことを目指しています。

主な研究テーマ

・盗葉緑体現象のメカニズム解明
・藻類化の進化原理の解明
・海洋・湖沼に広がる細胞内共生現象の多様性の探索

最近の代表的な論文

• Onuma R, Hirooka S, Kanesaki Y, Fujiwara T, Yoshikawa H, Miyagishima S (2020).
  Changes in the transcriptome, ploidy, and optimal light intensity of a cryptomonad upon integration into a kleptoplastic dinoflagellate.
  The ISME Journal 14: 2407–2423.
  
• Ohbayashi R, Hirooka S, Onuma R, Kanesaki Y, Hirose Y, Kobayashi Y, Fujiwara T, Furusawa T, Miyagishima, S. (2020).
  Evolutionary changes in DnaA-dependent chromosomal replication in cyanobacteria.
  Frontiers in microbiology 11: 786.
  
• Uzuka A*, Kobayashi Y*, Onuma R*, Hirooka S, Kanesaki Y, Yoshikawa H, Fujiwara T, Miyagishima S. (2019)
  Responses of unicellular predators to cope with the phototoxicity of photosynthetic prey.
  Nature Communications 10: 5606. (*; co-first author)
  
• Yamada N, Bolton JJ, Trobajo R, Mann DG, Dąbek P, Witkowski A, Onuma R, Horiguchi T, Kroth PG. (2019).
  Discovery of a kleptoplastic ‘dinotom’dinoflagellate and the unique nuclear dynamics of converting kleptoplastids to permanent plastids.
  Scientific Reports 9: 1-13.
  
• Yokouchi K, Onuma R, Horiguchi T. (2018).
  Ultrastructure and phylogeny of a new species of mixotrophic dinoflagellate, Paragymnodinium stigmaticum sp. nov.(Gymnodiniales, Dinophyceae).
  Phycologia 57: 539-554.
  
• Hirooka S, Hirose Y, Kanesaki Y, Higuchi S, Fujiwara T, Onuma R, Era A, Ohbayashi R, Uzuka A, Nozaki H, Yoshikawa H, Miyagishima S. (2017).
  Acidophilic green algal genome provides insights into adaptation to an acidic environment.
  Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 114: E8304-E8313.
  
• Onuma R, Neha M, Miyagishima S. (2017)
  Regulation of chloroplast and nucleomorph replication by the cell cycle in the cryptophyte Guillardia theta.
  Scientific Reports 7: 2345.
  
• Onuma R, Horiguchi T (2016)
  Specificity of Chroomonas (Cryptophyceae) as a sourceof kleptochloroplast for Nusuttodinium aeruginosum (Dinophyceae).
  Phycological Research 64: 35-43.
  
• Onuma R, Watanabe K, Horiguchi T (2015)
  Pellucidodinium psammophilum gen. & sp. nov. and Nusuttodinium desymbiontum sp. nov. (Dinophyceae), two novel heterotrophs closely related to kleptochloroplastidic dinoflagellates.
  Phycologia 54: 192-209.
  
• Onuma R, Horiguchi T (2015)
  Kleptochloroplast enlargement, karyoklepty and the distribution of the cryptomonad nucleus in Nusuttodinium (= Gymnodinium) aeruginosum (Dinophyceae).
  Protist 166: 177-195.
  
• Gómez F, Onuma R, Artigas LF, Horiguchi T. (2015)
  A new definition of Adenoides eludens, an unusual marine sand-dwelling dinoflagellate without cingulum, and Pseudadenoides kofoidii gen. & comb. nov. for the species formerly known as Adenoides eludens.
  European Journal of Phycology 50: 125-138.
  
• Watanabe K, Miyoshi Y, Kubo F, Onuma R, Murray S, Horiguchi T. (2014).
  Ankistrodinium armigerum sp. nov.(Dinophyceae), a new species of heterotrophic marine sand‐dwelling dinoflagellate from Japan and Australia.
  Phycological research 62: 125-135.
  
• Onuma R, Horiguchi T. (2013)
  Morphological transition in kleptochloroplasts after ingestion in the dinoflagellates Amphidinium poecilochroum and Gymnodinium aeruginosum (Dinophyceae).
  Protist 164: 622–642.
  
• Hagino K, Onuma R, Kawachi M, Horiguchi T. (2013)
  Discovery of an endosymbiotic nitrogen-fixing cyanobacterium UCYN-A in Braarudosphaera bigelowii (Prymnesiophyceae).
  PloS one 8: e81749.
  

連絡先

建物・部屋番号:　マリンサイト　2-006 （オフィス）、2-001（実験室）

電話:　0799-72-2907（直通）

E-mail:　ryoonuma@harbor.kobe-u.ac.jp

URL:　 https://sites.google.com/view/ryo-onuma-kleptoplasty/(個人サイト)
https://onuma-endosymbiosis.com/(研究室サイト)
http://www.research.kobe-u.ac.jp/rcis-kurcis/kyoten2020/facility.htm(マリンサイト)