准教授：工樂　樹洋（くらく　しげひろ）

学位：理学博士

担当授業科目

（大学院）発生生物学特論I,II、論文講究I,II、特定研究I,II、特定研究

研究の興味

　当研究室では、先端的なDNA解析技術とバイオインフォマティクスを駆使し、脊椎動物のゲノム構造やエピゲノム制御をおもな対象として、遺伝子や他の機能因子の多様性と進化について研究を行っています。多様な脊椎動物の全ゲノムプロジェクトを主導しながら、そこから得た生物学的知見と技術運用のためのノウハウをヒトや実験動物の広範な生命科学研究につなげることをめざして、分子進化学的・ゲノム学的視野に立った生物多様性リテラシーの普及のための活動も行っています。

主な研究テーマ

・脊椎動物の発生制御遺伝子の分子進化
・DNAシークエンス法やゲノム情報解析法の検討と最適化
・エピゲノミクスをはじめとするオミクス解析
・大型海棲脊椎動物など重要でありながら情報が乏しい生物の分子情報整備

最近の代表的な論文

• Hara Y, Yamaguchi K, Onimaru K, Kadota M, Koyanagi M, Keeley SD, Tatsumi K, Tanaka K, Motone F, Kageyama Y, Nozu R, Adachi N, Nishimura O, Nakagawa R, Tanegashima C, Kiyatake I, Matsumoto R, Murakumo K, Nishida K, Terakita S, Kuratani S, Sato K, Hyodo S, Kuraku S. (2018)
  Shark genomes provide insights into elasmobranch evolution and the origin of vertebrates.
  Nature Ecology and Evolution, doi: 10.1038/s41559-018-0673-5.
  
• Hara Y, Takeuchi M, Kageyama Y, Tatsumi K, Hibi M, Kiyonari H, Kuraku S. (2018)
  Madagascar ground gecko genome analysis characterizes asymmetric fates of duplicated genes.
  BMC Biology 16:40.
  
• Onimaru K, Kuraku S. (2018)
  Inference of the ancestral vertebrate phenotype through vestiges of the whole genome duplications.
  Briefings in Functional Genomics 17(5), 352-361.
  
• 工樂 樹洋
  円口類ヌタウナギとヤツメウナギの分子進化学
  月刊海洋 Vol.49, No.5, 2017
  
• Nishimura O, Hara Y, Kuraku S. (2017)
  gVolante for standardizing completeness assessment of genome and transcriptome assemblies.
  Bioinformatics 33, 3635-3637.
  
• Kadota M, Hara Y, Tanaka K, Takagi W, Tanegashima C, Nishimura O, Kuraku S.(2017)
  CTCF binding landscape in jawless fish with reference to Hox cluster evolution.
  Sci Rep 7(1), 4957.
  
• Kuraku S, Feiner N, Keeley SD, Hara Y. (2016)
  Incorporating tree-thinking and evolutionary time scale into developmental biology.
  Dev Growth Diff 58(1), 131-42.
  
• Kuraku S. (2013)
  Impact of asymmetric gene repertoire between cyclostomes and gnathostomes.
  Semin Cell Dev Biol 24(2), 119-127.
  

連絡先

建物・部屋番号:　理化学研究所 生命機能科学研究センター 発生再生研究棟 C棟 2階 S204号室

住所:　〒650-0047　神戸市中央区港島南町2-2-3

電話:　078-306-3048

ファックス:　078-306-3048

E-mail:　shigehiro.kuraku[at]riken.jp

ホームページアドレス:　https://www.bdr.riken.jp/jp/research/labs/kuraku-s/